Phase II erlaubt den Genuss von Blattsalaten, Pilzen, ausgewählter Rohkost, Nüssen, Gewürzen sowie geschältem Obst und Gemüse. Glutenhaltiges Brot sollte nur verzehrt werden, wenn es sich um Sauerteigbrot aus mindesten 70-90% Dinkel- oder Roggenvollkorn handelt. Auch Käse, Joghurt oder Kefir aus Biokuh-, Bioziegen- oder Bioschafsmilch und fermentierte Lebensmittel in Flüssigform sind erlaubt. Weiterhin zu meiden sind Gluten, Zucker, Alkohol (außer geringer Mengen Rotwein aus der Tannattraube), Auberginen, Paprika, Bohnen, Linsen und Soja. Fisch und Fleisch aus Massentierhaltung oder Getreidefütterung sollten ebenfalls unbedingt gemieden werden.